jobex with peecm error in rdgrad step

[flabia]

Dear all,

I am trying to minimise a cluster of ZnO, embedded in a 2D periodic slab. I have more clusters of different sizes: when I perform a jobex on  a cluster of 28 or 84 atoms, the optimizaton works fine, while when I try to optimize a bigger cluster (156 atoms) Turbomole crashes giving as output

error in rdgrad step

 when I run in parallel, and

error in dscf step

when I run a serial job.

The same input does not crash (i.e. the job completes succesfully) if I run a single point calculation (ridft).
Furthermore, if I remove the $embed section from control file, also the jobex run gives no problems!

any help would be greatly appreciated!

[uwe]

Hello,

hard to say where the problem is without knowing the details. I'd recommend to send your input to the Turbomole support to get help.

Regards

Uwe

[flabia]

yes sorry, this is my input:

Code: [Select]

$embed
periodic 2
cell ang
     3.26304     5.19522    90.42796    90.00000    90.00000    90.00000
content ang
o      0.00000000000000     0.91069361784743     0.16279446130900
zn     0.00000000000000    -0.91069361784743    -0.16279446130900
o      1.63151891000000    -1.70745357094037    -0.79213390322946
zn     1.63151891000000     1.50774931154043    -0.65206655717846
o      1.63151891000000     0.87476267417643    -2.61320061231139
zn     1.63151891000000    -1.10177321128321    -2.71848405891139
o      0.00000000000000    -1.72673085115467    -3.61218074181506
zn     0.00000000000000     1.47532712909643    -3.53612489380046
o      0.00000000000000     0.91011998752943    -5.46879524683179
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057    -5.46879524683179
o      1.63151891000000    -1.68749046247057    -6.41075312870825
zn     1.63151891000000     1.51796083282943    -6.41075312870825
o      1.63151891000000     0.91011998752943    -8.29466889246118
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057    -8.29466889246118
o      0.00000000000000    -1.68749046247057    -9.23662677433765
zn     0.00000000000000     1.51796083282943    -9.23662677433765
o      0.00000000000000     0.91011998752943   -11.12054253809058
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057   -11.12054253809058
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -12.06250041996704
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -12.06250041996704
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -13.94641618371997
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -13.94641618371997
o      0.00000000000000    -1.68749046247057   -14.88837406559644
zn     0.00000000000000     1.51796083282943   -14.88837406559644
o      0.00000000000000     0.91011998752943   -16.77228982934937
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057   -16.77228982934937
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -17.71424771122583
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -17.71424771122583
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -19.59816347497876
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -19.59816347497876
o      0.00000000000000    -1.68749046247057   -20.54012135685522
zn     0.00000000000000     1.51796083282943   -20.54012135685522
o      0.00000000000000     0.91011998752943   -22.42403712060815
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057   -22.42403712060815
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -23.36599500248462
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -23.36599500248462
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -25.24991076623755
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -25.24991076623755
o      0.00000000000000    -1.68749046247057   -26.19186864811401
zn     0.00000000000000     1.51796083282943   -26.19186864811401
o      0.00000000000000     0.91011998752943   -28.07578441186694
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057   -28.07578441186694
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -29.01774229374341
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -29.01774229374341
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -30.90165805749634
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -30.90165805749634
o      0.00000000000000    -1.68749046247057   -31.84361593937280
zn     0.00000000000000     1.51796083282943   -31.84361593937280
o      0.00000000000000     0.91011998752943   -33.72753170312573
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057   -33.72753170312573
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -34.66948958500220
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -34.66948958500220
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -36.55340534875513
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -36.55340534875513
o      0.00000000000000    -1.68749046247057   -37.49536323063159
zn     0.00000000000000     1.51796083282943   -37.49536323063159
o      0.00000000000000     0.91011998752943   -39.37927899438452
zn     0.00000000000000    -1.07964961717057   -39.37927899438452
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -40.32123687626099
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -40.32123687626099
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -42.20515264001391
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -42.20515264001391
o      1.63151891000000    -1.68749046247057   -40.32123687626099
zn     1.63151891000000     1.51796083282943   -40.32123687626099
o      1.63151891000000     0.91011998752943   -42.20515264001391
zn     1.63151891000000    -1.07964961717057   -42.20515264001391
o      0.00000000000000    -1.68749046247057   -43.14711052189038
zn     0.00000000000000     1.51796083282943   -43.14711052189038
end
charges
 o    -1.40000
 zn    1.40000
end
cluster
zn     0.00000000000000     -1.72096084437220     -0.30763616245950
zn     3.08312306659703      2.84923159745436     -1.23222650656852
zn     0.00000000000000    -11.53850282172096     -0.30763616245950
zn     3.08312306659703     -6.96830849016773     -1.23222650656852
zn     0.00000000000000      8.09658113297655     -0.30763616245950
zn     3.08312306659703     12.66677357480311     -1.23222650656852
zn    -6.16624613319406     -1.72096084437220     -0.30763616245950
zn    -3.08312306659703      2.84923159745436     -1.23222650656852
zn    -6.16624613319406    -11.53850282172096     -0.30763616245950
zn    -3.08312306659703     -6.96830849016773     -1.23222650656852
zn    -6.16624613319406      8.09658113297655     -0.30763616245950
zn    -3.08312306659703     12.66677357480311     -1.23222650656852
zn     6.16624613319406     -1.72096084437220     -0.30763616245950
zn     9.24936919979109      2.84923159745436     -1.23222650656852
zn     6.16624613319406    -11.53850282172096     -0.30763616245950
zn     9.24936919979109     -6.96830849016773     -1.23222650656852
zn     6.16624613319406      8.09658113297655     -0.30763616245950
zn   -12.33249226638812     -1.72096084437220     -0.30763616245950
zn    -9.24936919979109      2.84923159745436     -1.23222650656852
zn    -9.24936919979109     -6.96830849016773     -1.23222650656852
zn    12.33249226638812     -1.72096084437220     -0.30763616245950
o      0.00000000000000      1.72096084437220      0.30763616245950
o      3.08312306659703     -3.22661946079069     -1.49691674087308
o      0.00000000000000     -8.09658113297655      0.30763616245950
o      3.08312306659703    -13.04415954841278     -1.49691674087308
o      0.00000000000000     11.53850282172096      0.30763616245950
o      3.08312306659703      6.59092251655807     -1.49691674087308
o     -6.16624613319406      1.72096084437220      0.30763616245950
o     -3.08312306659703     -3.22661946079069     -1.49691674087308
o     -6.16624613319406     -8.09658113297655      0.30763616245950
o     -3.08312306659703    -13.04415954841278     -1.49691674087308
o     -6.16624613319406     11.53850282172096      0.30763616245950
o     -3.08312306659703      6.59092251655807     -1.49691674087308
o      6.16624613319406      1.72096084437220      0.30763616245950
o      9.24936919979109     -3.22661946079069     -1.49691674087308
o      6.16624613319406     -8.09658113297655      0.30763616245950
o      6.16624613319406     11.53850282172096      0.30763616245950
o      9.24936919979109      6.59092251655807     -1.49691674087308
o    -12.33249226638812      1.72096084437220      0.30763616245950
o     -9.24936919979109     -3.22661946079069     -1.49691674087308
o     -9.24936919979109      6.59092251655807     -1.49691674087308
o     12.33249226638812      1.72096084437220      0.30763616245950
zn    15.41561533298515      2.84923159745436     -1.23222650656852
zn    12.33248848693479      8.09658113297655     -0.30763616245950
o     15.41561533298515     -3.22661946079069     -1.49691674087308
o     12.33248848693479     -8.09658113297655      0.30763616245950
zn   -12.33248848693479      8.09658113297655     -0.30763616245950
zn   -15.41561533298515      2.84923159745436     -1.23222650656852
o    -12.33248848693479     -8.09658113297655      0.30763616245950
o    -15.41561533298515     -3.22661946079069     -1.49691674087308
zn    -9.24936919979109     12.66677357480311     -1.23222650656852
zn     9.24936919979109     12.66677357480311     -1.23222650656852
o     -9.24936919979109    -13.04415954841278     -1.49691674087308
o      9.24936919979109    -13.04415954841278     -1.49691674087308
o      3.08312306659703     16.40845882472683     -1.49691674087308
o     -3.08312306659703     16.40845882472683     -1.49691674087308
zn     3.08312306659703    -16.78585613669648     -1.23222650656852
zn    -3.08312306659703    -16.78585613669648     -1.23222650656852
zn     3.08312306659703     -2.08204981523575     -5.13718791967286
zn     0.00000000000000      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn     3.08312306659703    -11.89958990285785     -5.13718791967286
zn     0.00000000000000     -7.02957909777873     -6.68230591855210
zn     3.08312306659703      7.73549216211300     -5.13718791967286
zn     0.00000000000000     12.60550485691878     -6.68230591855210
zn    -3.08312306659703     -2.08204981523575     -5.13718791967286
zn    -6.16624613319406      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn    -3.08312306659703    -11.89958990285785     -5.13718791967286
zn    -6.16624613319406     -7.02957909777873     -6.68230591855210
zn    -3.08312306659703      7.73549216211300     -5.13718791967286
zn     9.24936919979109     -2.08204981523575     -5.13718791967286
zn     6.16624613319406      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn     6.16624613319406     -7.02957909777873     -6.68230591855210
zn     9.24936919979109      7.73549216211300     -5.13718791967286
zn    -9.24936919979109     -2.08204981523575     -5.13718791967286
zn   -12.33249226638812      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn   -12.33249226638812     -7.02957909777873     -6.68230591855210
zn    -9.24936919979109      7.73549216211300     -5.13718791967286
zn    12.33249226638812      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn    12.33249226638812     -7.02957909777873     -6.68230591855210
o      3.08312306659703      1.65306107562561     -4.93823182735850
o      0.00000000000000     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o      3.08312306659703     -8.16448090172314     -4.93823182735850
o      0.00000000000000    -13.08058969903193     -6.82603096967204
o      3.08312306659703     11.47060305297437     -4.93823182735850
o      0.00000000000000      6.55449425566558     -6.82603096967204
o     -3.08312306659703      1.65306107562561     -4.93823182735850
o     -6.16624613319406     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o     -3.08312306659703     -8.16448090172314     -4.93823182735850
o     -3.08312306659703     11.47060305297437     -4.93823182735850
o     -6.16624613319406      6.55449425566558     -6.82603096967204
o      9.24936919979109      1.65306107562561     -4.93823182735850
o      6.16624613319406     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o      9.24936919979109     -8.16448090172314     -4.93823182735850
o      6.16624613319406      6.55449425566558     -6.82603096967204
o     -9.24936919979109      1.65306107562561     -4.93823182735850
o    -12.33249226638812     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o     -9.24936919979109     -8.16448090172314     -4.93823182735850
o    -12.33249226638812      6.55449425566558     -6.82603096967204
o     12.33249226638812     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o     12.33249226638812      6.55449425566558     -6.82603096967204
zn     0.00000000000000    -16.84712107512748     -6.68230591855210
zn    -6.16624613319406    -16.84712107512748     -6.68230591855210
zn     9.24936919979109    -11.89958990285785     -5.13718791967286
zn     6.16624613319406    -16.84712107512748     -6.68230591855210
zn    -9.24936919979109    -11.89958990285785     -5.13718791967286
o      3.08312306659703    -17.98201532016524     -4.93823182735850
o     -6.16624613319406    -13.08059347848525     -6.82603096967204
o     -3.08312306659703    -17.98201532016524     -4.93823182735850
o      6.16624613319406    -13.08059347848525     -6.82603096967204
zn     3.08312306659703     17.55302847028176     -5.13718791967286
zn    -6.16624613319406     12.60549729801212     -6.68230591855210
zn    -3.08312306659703     17.55302847028176     -5.13718791967286
zn     6.16624613319406     12.60549729801212     -6.68230591855210
o      0.00000000000000     16.37204379192099     -6.82603096967204
o     -6.16624613319406     16.37204379192099     -6.82603096967204
o      9.24936919979109     11.47060305297437     -4.93823182735850
o      6.16624613319406     16.37204379192099     -6.82603096967204
o     -9.24936919979109     11.47060305297437     -4.93823182735850
zn    15.41561533298515     -2.08204981523575     -5.13718791967286
zn    15.41561533298515      7.73549216211300     -5.13718791967286
zn    18.49874217903550      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn    18.49874217903550     -7.02957909777873     -6.68230591855210
o     15.41561533298515      1.65306107562561     -4.93823182735850
o     15.41561533298515     -8.16448090172314     -4.93823182735850
o     18.49874217903550     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o     18.49874217903550      6.55449425566558     -6.82603096967204
zn   -15.41561533298515     -2.08204981523575     -5.13718791967286
zn   -18.49874217903550      2.78796287957003     -6.68230591855210
zn   -18.49874217903550     -7.02957909777873     -6.68230591855210
zn   -15.41561533298515      7.73549216211300     -5.13718791967286
o    -15.41561533298515      1.65306107562561     -4.93823182735850
o    -18.49874217903550     -3.26304772168317     -6.82603096967204
o    -15.41561533298515     -8.16448090172314     -4.93823182735850
o    -18.49874217903550      6.55449425566558     -6.82603096967204
zn    12.33248848693479    -11.53850282172096     -0.30763616245950
zn    15.41561533298515     -6.96830849016773     -1.23222650656852
zn    18.49874217903550     -1.72096084437220     -0.30763616245950
o     12.33248848693479     11.53850282172096      0.30763616245950
o     15.41561533298515      6.59092251655807     -1.49691674087308
o     18.49874217903550      1.72096084437220      0.30763616245950
zn   -12.33248848693479    -11.53850282172096     -0.30763616245950
zn   -18.49874217903550     -1.72096084437220     -0.30763616245950
zn   -15.41561533298515     -6.96830849016773     -1.23222650656852
o    -12.33248848693479     11.53850282172096      0.30763616245950
o    -18.49874217903550      1.72096084437220      0.30763616245950
o    -15.41561533298515      6.59092251655807     -1.49691674087308
zn     0.00000000000000     17.91411744114532     -0.30763616245950
zn    -6.16624613319406     17.91411744114532     -0.30763616245950
zn     6.16624613319406     17.91411744114532     -0.30763616245950
o      9.24936919979109     16.40845882472683     -1.49691674087308
o     -9.24936919979109     16.40845882472683     -1.49691674087308
zn     9.24936919979109    -16.78585613669648     -1.23222650656852
zn    -9.24936919979109    -16.78585613669648     -1.23222650656852
o      0.00000000000000    -17.91411744114532      0.30763616245950
o     -6.16624613319406    -17.91411744114532      0.30763616245950
o      6.16624613319406    -17.91411744114532      0.30763616245950
end
$title
$disp
$operating system unix
$symmetry c1
$redundant    file=coord
$coord    file=coord
$user-defined bonds    file=coord
$atoms
zn 1-21,43-44,47-48,51-52,57-79,101-105,110-113,119-122,127-130,135-137,       \
   141-143,147-149,152-153                                                     \
   basis =zn def2-SV(P)                                                        \
   jbas  =zn def2-SV(P)
o  22-42,45-46,49-50,53-56,80-100,106-109,114-118,123-126,131-134,138-140,     \
   144-146,150-151,154-156                                                     \
   basis =o def2-SV(P)                                                         \
   jbas  =o def2-SV(P)
$basis    file=basis
$rundimensions
   dim(fock,dens)=5119881
   natoms=156
   nshell=1248
   nbf(CAO)=3198
   nbf(AO)=2964
   dim(trafo[SAO<-->AO/CAO])=3666
   rhfshells=1
$scfmo   file=mos
$closed shells
 a       1-1482                                 ( 2 )
$scfiterlimit      399
$thize     0.10000000E-04
$thime        5
$scfintunit
 unit=30       size=0        file=twoint
$scfdiis
$scforbitalshift  automatic=.1
$drvopt
   cartesian  on
   basis      off
   global     off
   hessian    on
   dipole     on
   nuclear polarizability
$interconversion  off
   qconv=1.d-7
   maxiter=25
$optimize
   internal   on
   redundant  on
   cartesian  off
   global     off
   basis      off   logarithm
$coordinateupdate
   dqmax=0.3
   interpolate  on
   statistics    5
$forceupdate
   ahlrichs numgeo=0  mingeo=3 maxgeo=4 modus=<g|dq> dynamic fail=0.3
   threig=0.005  reseig=0.005  thrbig=3.0  scale=1.00  damping=0.0
$forceinit on
   diag=default
$energy    file=energy
$grad    file=gradient
$forceapprox    file=forceapprox
$lock off
$dft
   functional pbe
   gridsize   m4
$scfconv        7
$scfdamp   start=0.700  step=0.050  min=0.050
$ricore        0
$ricore_slave  1
$rij
$jbas    file=auxbasis
$marij
$last step      define
$end


PS: I know there are not ECPs and the results may be unphysical, but the problem here is that the SCF run does not even start...

OK, problem solved, I was using TUBOMOLE v 6.0, and the problem disappears when using v 6.3.

Thanks