Author Topic: possible cosmo bug  (Read 8867 times)

scope

  • Jr. Member
  • **
  • Posts: 18
  • Karma: +0/-0
possible cosmo bug
« on: February 14, 2008, 03:19:57 PM »
Hi everybody,
we tried to run a cosmo calculation on the RI-PBE0 level. The system has c3v symmetry. When trying to do a ridft singlepoint with cosmo switched on, the program crashes after convergence with a PGFIO sequential read/write error.
The same happens when we turn symmetry down to C1, run a singlepoint on that symmetry, then run cosmo.
Other cosmo calculations work fine, even on the very same level of theory. The same calculation works >without< RI (and it doesn´t matter if c3v or c1 is the symmetry).
There is enough disk space and free memory.
The control and coord files are attached. Is this a bug or is there a mistake in our input ?

CONTROL:
$cosmo
  epsilon=   36.640
  rsolv= 1.30
$cosmo_atoms
# radii in Angstrom units
h  1,5-7                                                                       \
   radius=  1.3000
n  2                                                                           \
   radius=  1.8300
c  3-4                                                                         \
   radius=  2.0000
$cosmo_out file=out.cosmo
$title
$operating system unix
$symmetry c1
$redundant    file=coord
$coord    file=coord
$user-defined bonds    file=coord
$atoms
h  1,5-7                                                                       \
   basis =h def-TZVP                                                           \
   jbas  =h def-TZVP
n  2                                                                           \
   basis =n def-TZVP                                                           \
   jbas  =n def-TZVP
c  3-4                                                                         \
   basis =c def-TZVP                                                           \
   jbas  =c def-TZVP
$basis    file=basis
$rundimensions
   dim(fock,dens)=3654
   natoms=7
   nshell=43
   nbf(CAO)=84
   nbf(AO)=81
   dim(trafo[SAO<-->AO/CAO])=90
   rhfshells=1
$scfmo   file=mos
$closed shells
 a       1-11                                   ( 2 )
$scfiterlimit       30
$thize     0.10000000E-04
$thime        5
$scfdump
$scfintunit
 unit=30       size=0        file=twoint
$scfdiis
$scforbitalshift  automatic=.1
$drvopt
   cartesian  on
   basis      off
   global     off
   hessian    on
   dipole     on
   nuclear polarizability
$interconversion  off
   qconv=1.d-7
   maxiter=25
$optimize
   internal   on
   redundant  on
   cartesian  off
   global     off
   basis      off   logarithm
$coordinateupdate
   dqmax=0.3
   interpolate  on
   statistics    5
$forceupdate
   ahlrichs numgeo=0  mingeo=3 maxgeo=4 modus=<g|dq> dynamic fail=0.3
   threig=0.005  reseig=0.005  thrbig=3.0  scale=1.00  damping=0.0
$forceinit on
   diag=default
$energy    file=energy
$grad    file=gradient
$forceapprox    file=forceapprox
$lock off
$dft
   functional pbe0
   gridsize   m4
$ricore     1100
$jbas    file=auxbasis
$scfconv   6
$scfdamp   start=0.700  step=0.050  min=0.050
$last step     dscf
$last SCF energy change = -.10357159
$dipole from dscf
  x     0.00000549536900    y    -0.00022773026001    z    -0.41435971630662    a.u.
   | dipole | =    1.0532054652  debye
$orbital_max_rnorm 0.98549731028928E-04
$end

COORD:
$coord
    0.00000000000000      0.00000000000000     -4.25763310430875      h
    0.00000000000000      0.00000000000000     -2.35016022747579      n
    0.00000000000000      0.00000000000000     -0.19909399195327      c
    0.00000000000000      0.00000000000000      2.49767311912018      c
   -0.97735225386244      1.69282376058170      3.17502075626074      h
   -0.97735225386244     -1.69282376058170      3.17502075626074      h
    1.95470450772488      0.00000000000000      3.17502075626074      h
$redundant
     number_of_atoms             7
     degrees_of_freedom         15
     internal_coordinates       15
     frozen_coordinates          0
# definitions of redundant internals
   1 k  1.0000000000000 stre    1    2           val=   1.90747
   2 k  1.0000000000000 stre    2    3           val=   2.15107
   3 k  0.8660254037844 linc    1    4    2    5 val=   0.00000
        0.8660254037844 linc    2    4    3    5
   4 k  0.8660254037844 linc    1    4    2    5 val=   0.00000
       -0.8660254037844 linc    2    4    3    5
   5 k  0.8660254037844 linp    1    4    2    5 val=   0.00000
        0.8660254037844 linp    2    4    3    5
   6 k  0.8660254037844 linp    1    4    2    5 val=   0.00000
       -0.8660254037844 linp    2    4    3    5
   7 k  1.0000000000000 stre    4    3           val=   2.69677
   8 k  1.0000000000000 stre    4    5           val=   2.06874
   9 k  1.0000000000000 stre    4    6           val=   2.06874
  10 k  1.0000000000000 stre    4    7           val=   2.06874
  11 k  0.4109908886962 bend    5    3    4      val=   0.38021
        0.4109908886962 bend    6    3    4
       -0.4054871425114 bend    6    5    4
        0.4109908886962 bend    7    3    4
       -0.4054871425114 bend    7    5    4
       -0.4054871425114 bend    7    6    4
  12 k  0.1504523143041 bend    5    3    4      val=   0.00000
        0.2856226483154 bend    6    3    4
        0.6751417792097 bend    6    5    4
       -0.4360749626196 bend    7    3    4
       -0.4422078759300 bend    7    5    4
       -0.2329339032797 bend    7    6    4
  13 k  0.4166723099468 bend    5    3    4      val=   0.00000
       -0.3386316812190 bend    6    3    4
        0.1208243844441 bend    6    5    4
       -0.0780406287279 bend    7    3    4
        0.5242777397298 bend    7    5    4
       -0.6451021241739 bend    7    6    4
  14 k  0.6857190637270 bend    5    3    4      val=   0.00000
       -0.3304805309288 bend    6    3    4
       -0.2294490352713 bend    6    5    4
       -0.3552385327982 bend    7    3    4
       -0.2134578093211 bend    7    5    4
        0.4429068445924 bend    7    6    4
  15 k  0.0142940390439 bend    5    3    4      val=   0.00000
       -0.6009971485688 bend    6    3    4
        0.3789523096235 bend    6    5    4
        0.5867031095249 bend    7    3    4
       -0.3881848482305 bend    7    5    4
        0.0092325386070 bend    7    6    4
        15 non zero eigenvalues  of BmBt
           1           3.777286648    1    0
         1
           2           3.406942024    2    0
         2
           3           3.406942024    3    0
         3
           4           2.760827154    4    0
         4
           5           1.351453584    5    0
         5
           6           1.286905519    6    0
         6
           7           1.286905519    7    0
         7
           8           0.862716218    8    0
         8
           9           0.740133975    9    0
         9
          10           0.740133975   10    0
        10
          11           0.694585077   11    0
        11
          12           0.694585077   12    0
        12
          13           0.265469055   13    0
        13
          14           0.194956891   14    0
        14
          15           0.194956891   15    0
        15
$user-defined bonds
$end


Cheers
Nils

uwe

  • Global Moderator
  • Sr. Member
  • *****
  • Posts: 486
  • Karma: +0/-0
Re: possible cosmo bug
« Reply #1 on: February 14, 2008, 05:00:16 PM »
Hi Nils,

please try the i786-pc-linux-gnu ridft binary and check if it runs. I assume that you want to get plain-text cosmo files and not ccfs ??

Uwe

scope

  • Jr. Member
  • **
  • Posts: 18
  • Karma: +0/-0
Re: possible cosmo bug
« Reply #2 on: February 15, 2008, 03:11:31 PM »
Thanks Uwe,
that works, and sorry I forgot to say that the error only happens with clear text output. I aliased the i786 version for use with cosmo for now.
So it seems to be a compilation problem, can this be fixed ?

Cheers
Nils

uwe

  • Global Moderator
  • Sr. Member
  • *****
  • Posts: 486
  • Karma: +0/-0
Re: possible cosmo bug
« Reply #3 on: February 15, 2008, 03:18:16 PM »
Hi,

the compiler in the version that we have used has problems with the optimization of one routine. We have fixed that and replaced the binaries in the release version.

Please copy Turbomole 5.10 for Linux/PC again from your ftp account and reinstall the x86_64 binaries. They should work correctly.

Regards,

Uwe