dealing with frozen atoms

Started by jbaltrus, February 06, 2013, 10:20:53 AM

Previous topic - Next topic

jbaltrus

I am getting seemingly insurmountable problems with both NumForce and aoforce. I have frozen atoms and would like to count them out so I get no negatives. So first I try pbe+dispersion def2-SVP

NumForce -ri -frznuclei -mfile $TMPDIR/turbomole.hosts > numforce.out

and every single displacement calculation ends up erroneous with a nonsense energy in the iteration

Starting SCF iterations

         Overall gridpoints after grid construction =        513581

ITERATION  ENERGY          1e-ENERGY        2e-ENERGY     NORM[dD(SAO)]  TOL
  1  -18400.683325537    -140166.61399     64374.982536    0.000D+00 0.156D-11
                           Exc = -1556.35781593     Coul =  65931.3403524    
                             N = 1235.9972650    
                           current damping = 0.700

         max. resid. norm for Fia-block=  1.873D-03 for orbital    299a        
         max. resid. fock norm         =  1.088D-02 for orbital   2025a        

ITERATION  ENERGY          1e-ENERGY        2e-ENERGY     NORM[dD(SAO)]  TOL
  2  -25250.371992198    -140166.60015     57525.280030    0.886D-02 0.988D-12
                           Exc = -23523.3261206     Coul =  81048.6061501    
                             N = 4497.4917208    
                           current damping = 0.650

         Norm of current diis error:  18.648    
         max. resid. norm for Fia-block=  1.570D-01 for orbital     28a        
         max. resid. fock norm         =  1.574D-01 for orbital     28a        
operating system is UNIX !
hostname is         compute-9-220.local

data group $actual step is not empty
due to the abend of ridft


check reason for abend ...

use the command  'actual -r'  to get rid of that


MODTRACE: no modules on stack

 CONTRL dead = actual step
rdgrad ended abnormally
$dipole from ridft
 x    -1.75611910909754    y    -0.80875050952608    z     1.02667129798734    a.u.
  | dipole | =    5.5641367862  debye
/Users/jbaltrus/CH3SH_ZSM5/HZSM5/numforce/KraftWerk/xm01

then I try aoforce with

h  122-169                                                                     \
  basis =h def2-SVP                                                           \
  jbas  =h def2-SVP                                                           \
  mass  =9999999.00000000

and I get lots of small negatives. I assume that if I specified mass as infinity I would get those zeroes out but not sure hot to completely get rid of them. Is my structure technically at the minimum and can I use this ZPE?

$vibrational spectrum
#  mode     symmetry     wave number   IR intensity    selection rules
#                         cm**(-1)        km/mol         IR     RAMAN
    1                       -0.53         0.00000        -       -
    2                       -0.38         0.00000        -       -
    3                       -0.35         0.00000        -       -
    4                       -0.35         0.00000        -       -
    5                       -0.32         0.00000        -       -
    6                       -0.26         0.00000        -       -
    7                       -0.22         0.00000        -       -
    8                       -0.22         0.00000        -       -
    9                       -0.22         0.00000        -       -
   10                       -0.22         0.00000        -       -
   11                       -0.20         0.00000        -       -
   12                       -0.19         0.00000        -       -
   13                       -0.19         0.00000        -       -
   14                       -0.19         0.00000        -       -
   15                       -0.18         0.00000        -       -
   16                       -0.17         0.00000        -       -
   17                       -0.17         0.00000        -       -
   18                       -0.17         0.00000        -       -
   19                       -0.17         0.00000        -       -
   20                       -0.16         0.00000        -       -
   21                       -0.15         0.00000        -       -
   22                       -0.15         0.00000        -       -
   23                       -0.15         0.00000        -       -
   24                       -0.15         0.00000        -       -
   25                       -0.15         0.00000        -       -
   26                       -0.14         0.00000        -       -
   27                       -0.14         0.00000        -       -
   28                       -0.14         0.00000        -       -
   29                       -0.13         0.00000        -       -
   30                       -0.13         0.00000        -       -
   31                       -0.13         0.00000        -       -
   32                       -0.12         0.00000        -       -
   33                       -0.12         0.00000        -       -
   34                       -0.11         0.00000        -       -
   35                       -0.11         0.00000        -       -
   36                       -0.11         0.00000        -       -
   37                       -0.11         0.00000        -       -
   38                       -0.10         0.00000        -       -
   39                       -0.10         0.00000        -       -
   40                       -0.10         0.00000        -       -
   41                       -0.10         0.00000        -       -
   42                       -0.10         0.00000        -       -
   43                       -0.09         0.00000        -       -
   44                       -0.09         0.00000        -       -
   45                       -0.09         0.00000        -       -
   46                       -0.08         0.00000        -       -
   47                       -0.08         0.00000        -       -
   48                       -0.08         0.00000        -       -
   49                       -0.07         0.00000        -       -
   50                       -0.07         0.00000        -       -
   51                       -0.07         0.00000        -       -
   52                       -0.06         0.00000        -       -
   53                       -0.06         0.00000        -       -
   54                       -0.05         0.00000        -       -
   55                       -0.04         0.00000        -       -
   56                       -0.02         0.00000        -       -
   57                        0.00         0.00000        -       -
   58                        0.00         0.00000        -       -
   59                        0.00         0.00000        -       -
   60                        0.00         0.00000        -       -
   61                        0.00         0.00000        -       -
   62                        0.00         0.00000        -       -
   63                        0.03         0.00000        -       -
   64                        0.03         0.00000        -       -
   65                        0.04         0.00000        -       -
   66                        0.05         0.00000        -       -
   67                        0.07         0.00000        -       -
   68                        0.07         0.00000        -       -
   69                        0.07         0.00000        -       -
   70                        0.09         0.00001        -       -
   71                        0.09         0.00000        -       -
   72                        0.10         0.00001        -       -
   73                        0.11         0.00000        -       -
   74                        0.11         0.00000        -       -
   75                        0.12         0.00000        -       -
   76                        0.12         0.00001        -       -
   77                        0.13         0.00001        -       -
   78                        0.13         0.00000        -       -
   79                        0.13         0.00000        -       -
   80                        0.14         0.00001        -       -
   81                        0.14         0.00001        -       -
   82                        0.14         0.00001        -       -
   83                        0.15         0.00000        -       -
   84                        0.15         0.00001        -       -
   85                        0.15         0.00000        -       -
   86                        0.16         0.00001        -       -
   87                        0.16         0.00002        -       -
   88                        0.16         0.00002        -       -
   89                        0.17         0.00000        -       -
   90                        0.17         0.00001        -       -
   91                        0.17         0.00000        -       -
   92                        0.18         0.00000        -       -
   93                        0.18         0.00001        -       -
   94                        0.18         0.00000        -       -
   95                        0.18         0.00002        -       -
   96                        0.19         0.00000        -       -
   97                        0.19         0.00002        -       -
   98                        0.19         0.00001        -       -
   99                        0.20         0.00003        -       -
  100                        0.20         0.00001        -       -
  101                        0.21         0.00002        -       -
  102                        0.21         0.00001        -       -
  103                        0.21         0.00002        -       -
  104                        0.22         0.00001        -       -
  105                        0.22         0.00001        -       -
  106                        0.23         0.00011        -       -
  107                        0.23         0.00009        -       -
  108                        0.24         0.00001        -       -
  109                        0.25         0.00004        -       -
  110                        0.25         0.00004        -       -
  111                        0.26         0.00001        -       -
  112                        0.26         0.00007        -       -
  113                        0.27         0.00001        -       -
  114                        0.28         0.00003        -       -
  115                        0.28         0.00000        -       -
  116                        0.28         0.00000        -       -
  117                        0.29         0.00003        -       -
  118                        0.30         0.00005        -       -
  119                        0.31         0.00001        -       -
  120                        0.32         0.00004        -       -
  121                        0.33         0.00025        -       -
  122                        0.33         0.00001        -       -
  123                        0.33         0.00002        -       -
  124                        0.35         0.00001        -       -
  125                        0.35         0.00002        -       -
  126                        0.35         0.00000        -       -
  127                        0.36         0.00003        -       -
  128                        0.37         0.00007        -       -
  129                        0.37         0.00000        -       -
  130                        0.39         0.00011        -       -
  131                        0.39         0.00001        -       -
  132                        0.40         0.00008        -       -
  133                        0.44         0.00010        -       -
  134                        0.45         0.00002        -       -
  135                        0.45         0.00012        -       -
  136                        0.46         0.00002        -       -
  137                        0.46         0.00001        -       -
  138                        0.47         0.00008        -       -
  139                        0.48         0.00001        -       -
  140                        0.48         0.00018        -       -
  141                        0.48         0.00001        -       -
  142                        0.49         0.00000        -       -
  143                        0.49         0.00000        -       -
  144                        0.50         0.00000        -       -
  145        a              28.16         2.62697       YES     YES
  146        a              49.33         0.47760       YES     YES
  147        a              57.82         1.39272       YES     YES
  148        a              60.93         0.51669       YES     YES
........